建筑设计加盟公司通常可以独立核算。这是因为大多数建筑设计公司的运营模式是提供设计服务，并通过与客户签订合同获得收入来盈利。这种模式下，总部和分店通常是独立的法人实体，各自承担相应的责任和风险。

然而具体能否单独核算是需要根据实际情况来判断的,比如建筑设计的品牌、技术实力以及合作方式等都是影响其是否能够独自计算的重要因素.因此建议咨询的财务顾问或直接联系相关公司提供的信息。